BibexPy v2.3: Kurulumdan Smart Merge, Harmonizasyon ve Dışa Aktarmaya Adım Adım Video Eğitim Serisi

Web of Science ve Scopus kayıtlarını kendi bilgisayarınızda birleştiren, filtreleyen, zenginleştiren ve VOSviewer / Biblioshiny formatlarına dönüştüren BibexPy v2.3 için hazırladığımız Türkçe ve İngilizce video rehberlerin güncel tam listesi.

Bibliyometrik bir araştırmaya veya sistematik literatür taramasına başladığınızda ilk birkaç saat her zaman heyecan vericidir. Araştırma sorularınızı netleştirir, arama sorgularınızı kurgular ve hem Web of Science (WoS) hem de Scopus üzerinden binlerce makalelik ham veri kümelerinizi indirirsiniz. Ancak o iki dosyayı yan yana açtığınız anda araştırmanın bilimsel kısmı durur ve yorucu bir veri temizleme mesaisi başlar.

Farklı sütun başlıkları, noktalama farkları yüzünden gözden kaçan mükerrer yayınlar, aynı yazarın beş farklı biçimde yazılmış kurum adresleri ve eksik DOI kayıtları… BibexPy’nin ilk sürümünü ve ardından tarayıcı tabanlı yerel web arayüzüne sahip BibexPy v2 (Helium) platformunu tam olarak bu sorunu çözmek için geliştirdik.

Yazılım büyüdükçe dünyanın farklı üniversitelerinden araştırmacılardan benzer bir talep gelmeye başladı: “Yazılı dokümantasyon çok ayrıntılı, ancak kurulumdan veri birleştirmeye, harmonizasyondan dışa aktarmaya kadar tüm adımları ekranda görerek takip edebileceğimiz kısa videolar olsa işimiz çok kolaylaşır.”

“İyi bir araştırma yazılımı yalnızca doğru sonuç üretmekle kalmamalı; farklı işletim sistemlerinde ve farklı teknik deneyim düzeylerindeki her araştırmacı için dakikalar içinde kurulabilir ve şeffaf biçimde uygulanabilir olmalıdır.”

Bu doğrultuda resmî YouTube kanalımız @BibexPy üzerinde hem Türkçe hem İngilizce oynatma listeleri hazırladık. Bu yazıda, kanalımızdaki tüm eğitim serilerini, işletim sistemi bazlı kurulum videolarını ve proje bağlantılarını tek bir çatı altında bulabilirsiniz.

1. BibexPy Kullanım Serisi (Türkçe · Bölüm 1–7)

Toplam 9 bölüm olarak kurgulanan BibexPy Kullanım Serisi (Türkçe), hiçbir adımı atlamadan sıfırdan yayına hazır bibliyometrik veri kümesi üretme sürecini gösteriyor. Her video yalnızca 1,5 ile 3 dakika arasında sürüyor ve doğrudan ilgili aşamaya odaklanıyor.

Bölüm #1 · Arayüz Turu ve Projeler

İlk bölümde yerel sunucuda (http://localhost:6060) çalışan ana ekranı, ilk kurulumda gerçek Web of Science ve Scopus örnek verisiyle hazır gelen Simple Project yapısını ve beş adımlı iş akışını (Data & Merge → Records & Filtering → Harmonization → Export → Report) inceliyoruz.

Bölüm #2 · Veri Dosyaları ve Smart Merge

İkinci bölümde ham Scopus (.csv) ve Web of Science (.txt) dosyalarının projeye nasıl yüklendiğini, Smart Merge algoritmasının tek tıkla nasıl çalıştırıldığını ve işlem sonunda makalenizin yöntem (Methodology) bölümüne doğrudan kopyalayabileceğiniz hazır metin paragrafının nasıl üretildiğini gösteriyoruz.

Bölüm #3 · Belirsiz Çiftleri İncelemek

Smart Merge yüksek güven düzeyindeki eşleşmeleri otomatik olarak birleştirirken, küçük başlık veya ayırıcı farkları nedeniyle sınırda kalan şüpheli çiftleri sessizce silmez. Üçüncü bölümde bu belirsiz çiftlerin yan yana karşılaştırma ekranında Aynı yayın, Farklı yayın veya Atla seçenekleriyle nasıl denetlendiğini ele alıyoruz.

Bölüm #4 · Kayıtlar ve Filtreleme

Dördüncü bölümde birleştirilmiş veri kümesi üzerinde hızlı filtrelerin ve çoklu filtre gruplarının nasıl kullanıldığını, AND, OR, NOT mantıksal operatörleriyle tam metin aramasını, oluşturulan süzgeçlerin tekrar kullanılabilir preset olarak kaydedilmesini, kayıt ayrıntı kartlarını ve toplu işlemleri inceliyoruz.

Bölüm #5 · Veri Kalitesi ve Zenginleştirme

Beşinci bölümde Veri Kalitesi Panosu (Data Quality Dashboard) üzerinden veri kümesinin sağlık puanını, sütun bazlı doluluk oranlarını, dışa aktarılabilir genel bakış tablosunu ve eksik üstveri alanlarının CrossRef, OpenAlex, Europe PMC ve DataCite gibi doğrulanabilir akademik kaynaklardan nasıl otomatik doldurulduğunu gösteriyoruz.

Bölüm #6 · Harmonizasyon

Altıncı bölümde bibliyometrik ağ haritalarının doğruluğunu doğrudan belirleyen harmonizasyon modüllerini, yazar ayrıştırma (Author Disambiguation) sürecindeki birleştirme ve ayırma işlemlerini ve belirsiz varyasyonlarda dil modeli destekli önerilerin nasıl değerlendirildiğini anlatıyoruz.

Bölüm #7 · Veri Dönüşümü (Dışa Aktarma)

Yedinci bölümde temizlenen veri kümesinin tamamını ya da seçili bir preset alt kümesini Web of Science, VOSviewer, BibTeX, RIS kaynakça formatlarında veya Excel (XLSX), CSV, TSV tablo formatlarında doğrudan analize hazır biçimde dışa aktarma adımlarını inceliyoruz.

2. İşletim Sistemine Göre Adım Adım Kurulum (BibexPy 2.3)

BibexPy, kullanıcı verilerinin gizliliğini korumak amacıyla bulutta değil, tamamen kendi bilgisayarınızda çalışır. Üstelik web arayüzü paketin içinde önceden derlenmiş olarak geldiği için bilgisayarınıza Node.js, Git veya derleyici kurmanız gerekmez; yalnızca Python 3.10 veya daha yeni bir sürüm yeterlidir.

BibexPy 2.3 Installation Guides oynatma listemizde Windows, macOS ve Linux için sıfırdan kurulumu hem Türkçe hem İngilizce olarak kaydettik.

Windows 10 ve 11 Kurulumu

Windows kurulumunda dikkat edilmesi gereken tek ayrıntı, Python yükleyicisinin ilk ekranındaki Add python.exe to PATH kutucuğunu işaretlemektir. Ardından PowerShell veya Komut İstemi üzerinden pip install bibexpy ve python -m bibexpy komutlarıyla arayüz doğrudan tarayıcınızda açılır.

macOS 11+ Kurulumu

macOS kullanıcıları için Python kurulumunun hemen ardından gelen Install Certificates.command adımı, zenginleştirme servisleriyle güvenli bağlantı kurulması açısından önemlidir. Kurulum pip3 install bibexpy ve python3 -m bibexpy komutlarıyla tamamlanır.

Linux (Ubuntu, Debian, Fedora) Kurulumu

Güncel Linux dağıtımlarında sistem Python ortamını koruyan PEP 668 kısıtlamasıyla karşılaşmamak için en temiz yöntem pipx kullanmaktır. Videoda pipx install bibexpy ile izole kurulumun nasıl yapıldığı adım adım gösterilmektedir.

# Windows
pip install bibexpy
python -m bibexpy

# macOS
pip3 install bibexpy
python3 -m bibexpy

# Linux (pipx)
sudo apt install -y pipx && pipx ensurepath
pipx install bibexpy
bibexpy

3. Uluslararası Eğitim Serisi (English Series · Episodes 1–7) ve Shorts

Farklı ülkelerdeki ortak yazarlarımız ve uluslararası kullanıcı topluluğumuz için tüm kullanım ve kurulum serilerini İngilizce olarak da yayımlıyoruz. BibexPy Usage Series (English) ve BibexPy Shorts oynatma listelerindeki tüm bölümleri aşağıdan doğrudan izleyebilirsiniz.

English Installation Guides & Shorts

4. Tüm Oynatma Listeleri ve Proje Bağlantıları

BibexPy ekosistemindeki tüm kaynaklara, oynatma listelerine ve yalnız Smart Merge motorunu Google Colab veya terminal üzerinden çalıştırmak isteyenler için geliştirdiğimiz BibexPy-Lite sürümüne aşağıdaki dizinden ulaşabilirsiniz: